高通量數據生物資訊分析研習會:以單細胞RNA定序分析為例
Workshop on bioinformatics for high-throughput data: single-cell RNA sequencing data analysis
主辦單位
國家衛生研究院
指導單位
衛生福利部科技組

補(捐)助計畫:
主要計畫:
衛生福利部111至114年跨機構合作的癌症轉譯研究計畫-推動癌症轉譯研究跨機構合作平台及臨床研究資訊共享(計畫編號: MOHW111-TDU-B-221-114014)
其他計畫:
科技部生技醫藥生物資訊核心設施 (計畫編號: MOST 111-2740-B-400-002)

簡介

本次研習會旨在研討如何利用高通量數據(high-throughput data)所提供之特殊機會,來提高生物醫學實驗之真實性(validity)與再現性(reproducibility),並促進各相關領域的合作。在各種高通量數據產生之技術平台中,單細胞RNA定序(single-cell RNA sequencing)技術近來發展趨於成熟的重要技術,已經在腫瘤學、免疫學被大量應用,對於深入探究腫瘤組織之異質性(heterogeneity)以及腫瘤微環境之組成細胞在單細胞層次之異常變化,開拓了許多前所未見的新研究方向,將有助於癌症研究同好開發新的診斷或預後標記與治療方法。

有鑒於此,此次課程將簡介此技術之基本原理與資料產生流程,並於實作課程演練使用開放平台可用以分析的套裝軟體,適合對單細胞技術應用與其資料分析有興趣者參加。參加實作課程學員須具備使用R套件之基本知識。

時間
111年9月 21 日 星期三

地點
國家衛生研究院
行政大樓B1第三會議室 (上午)
圖資大樓5F電腦教室 (下午)

報名費
本教育訓練課程為免費,提供111至114年跨機構合作的癌症轉譯研究計畫機構優先報名,額滿為止(已額滿)

上課人數
【上午解說】100名
【下午實作】40名(其中20名需自備電腦,依報名優先順序安排)
課程: 111年9月 21 日 星期三
Time Topic Speaker
08:30~09:00 Registration/報到
09:00~09:05 Opening Remarks/開幕致詞 劉柯俊執行長
09:05~09:40 Opportunities and challenges of high-throughput biological data.
高通量數據分析的生物資訊學: 機會與挑戰
張憶壽名譽研究員
09:40~09:50 Q&A
09:50~10:25 Introduction on generation of single-cell RNA sequencing data
單細胞RNA定序資料產生之簡介
江士昇副研究員
10:25~10:35 Q&A
10:35~10:45 Break/休息
10:45~11:15 Advanced analysis for single cell RNA sequencing data: pathway analysis 單細胞RNA定序資料分析簡介:路徑分析 陳中興專案助研究員
11:15~11:45 Advanced analysis for single cell RNA sequencing data:pseudotime (trajectory) analysis 單細胞RNA定序資料分析簡介:擬時(軌跡)分析 江士昇副研究員
陳中興專案助研究員
吳怡儒博士
李詩苗博士
11:45~12:00 Q&A
12:00~13:30 Lunch break/午餐
13:30~15:00 Handson-practice: Seurat package for single cell RNA sequencing data analysis 實作練習:Seurat套件於單細胞RNA定序資料分析之應用 江士昇副研究員
陳中興專案助研究員
蔡芳榆女士
助教:
李詩苗博士
吳怡儒博士
周松濤博士
15:00~15:30 Handson-practice: pathway analysis for single cell RNA sequencing data using GSVA 實作練習:GSVA套件於單細胞RNA定序資料路徑分析之應用
15:30~16:00 Q&A
16:00~ 賦歸
講師:
*張憶壽 國家衛生研究院 癌症研究所 名譽研究員
*江士昇 國家衛生研究院 癌症研究所 副研究員
*陳中興 國家衛生研究院 癌症研究所 專案助研究員
*吳怡儒 國家衛生研究院 群體健康科學研究所 博士後研究員
*李詩苗 國家衛生研究院 群體健康科學研究所 博士後研究員
*蔡芳榆 國家衛生研究院 癌症研究所 研究助理

實作課程助教:
*李詩苗 國家衛生研究院 群體健康科學研究所 博士後研究員
*周松濤 國家衛生研究院 群體健康科學研究所 博士級研究助理
報名方式:
  1. 線上報名:請至活動報名網頁報名,即日起至111年9月14日星期五或額滿為止。
  2. 活動網址: https://mohwcrp.tw/education/workshop/course_20220921.php
  3. 線上報名:請至https://mohwcrp.tw/workshop/
經費補助: 菸品健康福利捐

注意事項

  1. 報名參加者請填寫服務單位;並請提供正確E-mail,以便寄發報到通知。報名成功者將於 9月16日(星期五)E-mail通知上課說明。本教育訓練為免費,為維持上課品質,請於上課前10分鐘間完成報到。
  2. 電腦教室不能攜帶飲料進出 (包含食物及開水、飲料)。
  3. 上、下午場皆報名成功者敬備午餐,請憑餐券領取便當。
  4. 上、下午場完成訓練課程皆核發證書,提醒您課程結束時向工作人員索取,若參與全日課程,其證書將於下午場結束時一併發放。
  5. 本課程提供竹北高鐵站/竹南火車站接駁,院內亦有訪客停車位(待確認後公告)。

洽詢方式

國家衛生研究院 癌症研究計畫辦公室 黃小姐 或 洪小姐
電話:(037) 206166 轉 35131 / 35132
傳真:(037) 586463
E-mail:abbyhuang@nhri.edu.twHsincih@nhri.edu.tw

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