高通量數據生物資訊分析研習會：以單細胞RNA定序分析為例

高通量數據生物資訊分析研習會：以單細胞RNA定序分析為例
Workshop on bioinformatics for high-throughput data: single-cell RNA sequencing data analysis

主辦單位: 國家衛生研究院
指導單位: 衛生福利部科技組
補(捐)助計畫:: 主要計畫:
衛生福利部111至114年跨機構合作的癌症轉譯研究計畫-推動癌症轉譯研究跨機構合作平台及臨床研究資訊共享(計畫編號: MOHW111-TDU-B-221-114014)
其他計畫:
: 科技部生技醫藥生物資訊核心設施 (計畫編號: MOST 111-2740-B-400-002)

簡介

本次研習會旨在研討如何利用高通量數據(high-throughput data)所提供之特殊機會，來提高生物醫學實驗之真實性(validity)與再現性(reproducibility)，並促進各相關領域的合作。在各種高通量數據產生之技術平台中，單細胞RNA定序（single-cell RNA sequencing）技術近來發展趨於成熟的重要技術，已經在腫瘤學、免疫學被大量應用，對於深入探究腫瘤組織之異質性（heterogeneity）以及腫瘤微環境之組成細胞在單細胞層次之異常變化，開拓了許多前所未見的新研究方向，將有助於癌症研究同好開發新的診斷或預後標記與治療方法。

有鑒於此，此次課程將簡介此技術之基本原理與資料產生流程，並於實作課程演練使用開放平台可用以分析的套裝軟體，適合對單細胞技術應用與其資料分析有興趣者參加。參加實作課程學員須具備使用R套件之基本知識。

時間: 111年9月 21 日星期三
地點: 國家衛生研究院
行政大樓B1第三會議室 (上午)
圖資大樓5F電腦教室 (下午)
報名費: 本教育訓練課程為免費，提供111至114年跨機構合作的癌症轉譯研究計畫機構優先報名，額滿為止(已額滿)
上課人數: 【上午解說】100名
【下午實作】40名(其中20名需自備電腦，依報名優先順序安排)

課程: 111年9月 21 日星期三

Time	Topic	Speaker
08:30~09:00	Registration/報到
09:00~09:05	Opening Remarks/開幕致詞	劉柯俊執行長
09:05~09:40	Opportunities and challenges of high-throughput biological data. 高通量數據分析的生物資訊學: 機會與挑戰	張憶壽名譽研究員
09:40~09:50	Q&A
09:50~10:25	Introduction on generation of single-cell RNA sequencing data 單細胞RNA定序資料產生之簡介	江士昇副研究員
10:25~10:35	Q&A
10:35~10:45	Break/休息
10:45~11:15	Advanced analysis for single cell RNA sequencing data: pathway analysis 單細胞RNA定序資料分析簡介：路徑分析	陳中興專案助研究員
11:15~11:45	Advanced analysis for single cell RNA sequencing data:pseudotime (trajectory) analysis 單細胞RNA定序資料分析簡介：擬時（軌跡）分析	江士昇副研究員陳中興專案助研究員吳怡儒博士李詩苗博士
11:45~12:00	Q&A
12:00~13:30	Lunch break/午餐
13:30~15:00	Handson-practice: Seurat package for single cell RNA sequencing data analysis 實作練習：Seurat套件於單細胞RNA定序資料分析之應用	江士昇副研究員陳中興專案助研究員蔡芳榆女士助教: 李詩苗博士吳怡儒博士周松濤博士
15:00~15:30	Handson-practice: pathway analysis for single cell RNA sequencing data using GSVA 實作練習：GSVA套件於單細胞RNA定序資料路徑分析之應用	江士昇副研究員陳中興專案助研究員蔡芳榆女士助教: 李詩苗博士吳怡儒博士周松濤博士
15:30~16:00	Q&A
16:00~	賦歸

講師：
*張憶壽國家衛生研究院癌症研究所名譽研究員
*江士昇國家衛生研究院癌症研究所副研究員
*陳中興國家衛生研究院癌症研究所專案助研究員
*吳怡儒國家衛生研究院群體健康科學研究所博士後研究員
*李詩苗國家衛生研究院群體健康科學研究所博士後研究員
*蔡芳榆國家衛生研究院癌症研究所研究助理

實作課程助教：
*李詩苗國家衛生研究院群體健康科學研究所博士後研究員
*周松濤國家衛生研究院群體健康科學研究所博士級研究助理

報名方式：

線上報名：請至活動報名網頁報名，即日起至111年9月14日星期五或額滿為止。
活動網址: https://mohwcrp.tw/education/workshop/course_20220921.php
線上報名：請至https://mohwcrp.tw/workshop/

經費補助: 菸品健康福利捐

注意事項

報名參加者請填寫服務單位；並請提供正確E-mail，以便寄發報到通知。報名成功者將於 9月16日(星期五)E-mail通知上課說明。本教育訓練為免費，為維持上課品質，請於上課前10分鐘間完成報到。
電腦教室不能攜帶飲料進出 (包含食物及開水、飲料)。
上、下午場皆報名成功者敬備午餐，請憑餐券領取便當。
上、下午場完成訓練課程皆核發證書，提醒您課程結束時向工作人員索取，若參與全日課程，其證書將於下午場結束時一併發放。
本課程提供竹北高鐵站/竹南火車站接駁，院內亦有訪客停車位(待確認後公告)。

洽詢方式

國家衛生研究院癌症研究計畫辦公室黃小姐或洪小姐
電話：(037) 206166 轉 35131 / 35132
傳真：(037) 586463
E-mail：abbyhuang@nhri.edu.tw 或 Hsincih@nhri.edu.tw