癌症研究相關之單細胞RNA定序實驗數據分析研習會
Workshop on the analysis of single-cell RNA sequencing data in cancer research
主辦單位
國家衛生研究院
指導單位
衛生福利部科技發展組

補(捐)助計畫:
主要計畫:
衛生福利部推動癌症轉譯研究跨機構合作平台及臨床研究資訊共享(計畫編號: MOHW112-TDU-B-222-124014)
其他計畫:
科技部生技醫藥生物資訊核心設施 (計畫編號: NSTC 112-2740-B-400-005)

簡介

本次研習會旨在研討如何利用高通量數據(high-throughput data)所提供之特殊機會,來提高生物醫學實驗之真實性(validity)與再現性(reproducibility),並促進各相關領域的合作。在各種高通量數據產生之技術平台中,單細胞RNA定序(single-cell RNA sequencing)技術近來發展趨於成熟的重要技術,已經在腫瘤學、免疫學被大量應用,對於深入探究腫瘤組織之異質性(heterogeneity)以及腫瘤微環境之組成細胞在單細胞層次之異常變化,開拓了許多前所未見的新研究方向,將有助於癌症研究同好開發新的診斷或預後標記與治療方法。

有鑒於此,此次課程將簡介此技術之基本原理與資料產生流程,並於實作課程演練使用開放平台可用以分析的套裝軟體,適合對單細胞技術應用與其資料分析有興趣者,歡迎踴躍參加~


報名資格及費用
  1. 學員須具備使用R套件之基本知識
  2. 本課程為免費,學員正取以執行衛生福利部111至114年跨機構合作的癌症轉譯研究計畫機構/研究團隊優先,請於報名時勾選所屬計畫,額滿為止。

課程: 112 年 5 月 17 日 星期三
Time Topic Speaker
08:30~09:00 Registration/報到
09:00~09:05 Opening Remarks/開幕致詞 劉柯俊執行長
09:05~09:35 Some aspects of biomedical data sciences: risk prediction models, GWAS, TWAS, and beyond
生醫資料科學的若干面向
張憶壽
名譽研究員
09:35~09:45 Q&A
09:45~10:30 Introduction on generation and analysis of single-cell RNA sequencing data
單細胞RNA定序資料產生與數據分析簡介
江士昇
副研究員
10:30~10:40 Q&A
10:40~10:50 Break/休息
10:50~11:20 Update in single-cell RNA sequencing and spatial genomics technologies for cancer research
應用於癌症研究之單細胞RNA定序與空間基因組學新技術與原理簡介
郭榮哲
應用科學家
11:20~11:50 Utilization of single-cell RNA-sequencing data in the public domain for cancer research
公共資料庫中單細胞RNA定序資料於癌症研究之應用簡介
江士昇 副研究員
蔡芳榆 女士
11:50~12:00 Q&A
12:00~13:00 Lunch break/午餐
13:00~14:30 Hands-on practice: Seurat package for single-cell RNA sequencing data analysis
實作練習:Seurat套件於單細胞RNA定序資料分析之應用
江士昇 副研究員
李詩苗 博士
助教:
蔡芳榆 女士
14:30-14:45 Break/休息
14:45~15:30 Hands-on practice: Cell-cell interaction/communication analysis based on single-cell RNA sequencing data
實作練習:以單細胞RNA定序資料為基礎之細胞間交互作用分析
江士昇 副研究員
吳怡儒 博士
助教:
蔡芳榆 女士
15:30~16:00 Q&A
講師:
*張憶壽 國家衛生研究院 癌症研究所 名譽研究員
*江士昇 國家衛生研究院 癌症研究所 副研究員
*郭榮哲 世基生物醫學股份有限公司 應用科學家
*李詩苗 國家衛生研究院 感染症與疫苗研究所 博士後研究員
*吳怡儒 國家衛生研究院 群體健康科學研究所 博士後研究員
*蔡芳榆 國家衛生研究院 癌症研究所 研究助理

實作課程助教:
*蔡芳榆 國家衛生研究院 癌症研究所 研究助理
報名方式:
  1. 線上報名:請至活動報名網頁報名。
  2. 活動網址: https://mohwcrp.tw/education/workshop/course_20230517
  3. (新增)數位課程報名:請至https://mohwcrp.tw/workshop/
經費補助: 菸品健康福利捐

注意事項

  1. 本數位課程為免費課程。
  2. 報名上課者請詳實填寫報名資訊(姓名及E-mail),俾利寄送上課證明電子檔。
  3. 上課證明取得資格,每堂課程觀看度須達90%(以每堂課程總時間估算)以上及填寫滿意度問卷,證書將於每月5日固定核發;如有任何問題或建議亦歡迎於問卷提問。
  4. 若無法一次完成所選擇學習課程,可依前次報名資訊再次登入完成課程。
  5. 主辦單位保有最終修改、變更、暫停或終止本課程內容之權利,並以網站公告為準,若有其他未盡事宜,悉依本課程相關規定或解釋。

洽詢方式

國家衛生研究院 癌症研究計畫辦公室 洪小姐 或 黃小姐
電話:(037) 206166 轉 35132 / 35131
傳真:(037) 586463
E-mail:Hsincih@nhri.edu.tw 或 abbyhuang@nhri.edu.tw

TOP